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電気泳動で必要な試料・試薬のセットが「基本セット」です。
基本セットで提供される試料は、上図に示したような過程を経て作成されます。
ミナミメダカとキタノメダカ、両者の雑種（Ｆ１）から、DNAを抽出します。抽出物には核DNAだけでなく、ミトコンドリアDNAも含まれます。
次に、核DNAとミトコンドリアDNAの一部を別々にPCRで増幅します。
さらに、核DNAとミトコンドリアDNAから得たPCR産物を、別々の制限酵素で処理して、最終試料とします。
解説 ミナミメダカとキタノメダカ 核DNAとミトコンドリアDNA
ここで、雑種Ｆ１と表記してありますが、実は２通りの場合があって、♀ミナミメダカ×♂キタノメダカの場合と、♀キタノメダカ×♂ミナミメダカ の場合があります。基本キットの試料を電気泳動してできたバンドパターンを見ると、どちらの場合であるかを判定することができます。
そこで、生徒向けに、母親はどっち？ という「課題」を設定します。
実際のバンドパターンの例を次に示します。
核DNAに注目すると、Ｆ１は両親のパターンが重なったものとなっています。
ミトコンドリアDNAに注目すると、Ｆ１は片方の親のパターンのみが出ています。
ミトコンドリアは母親のものしか受け継がれないので、 母親とＦ１は同じパターンとなるはずです。
ですから、この場合のＦ１の母親はミナミメダカであることがわかります。
基本セットの内容と学校で用意するもの 基本セットの実験操作と授業展開
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